1929年，石原以《战争史大观》、《迴转国运的根本国策——满蒙问题解决案》和《关东军满蒙领有计划》三篇文章惊艷了参谋部。在《战争史大观》中石原不仅强调了飞机在未来战争中的作用，而且指出了原子核裂变能量在军事中的应用。石原说「使用这种能量的破坏力可能使战争在一瞬间就决出胜负」，「怪力光线武器什么的突然出现也有可能」。
在对中国的作战中，石原冷静地指出速胜论是根本不可行的。他说：「如果进入战争状态就一定是长期持久战，只需要短期决战是极大的错误。一直到明治维新为止中国都是亚洲的先进国家而令人害怕，日本人则从甲午战争战胜了中国以后就认为中国是一个老衰的国家而看不起它。中国有自古而来的高度文明，而物质生活又极为原始，各个地方有高度的自给自足的可能，这些都成为对持久战的极为有利的条件。如果开战，有可能逼迫中国进行决战，但是会不会变成持久战则主要取决于中国的意图」。这些情况正在逐渐变成现实。
1936年，石原进入参谋本部后立即重新修订了《帝国国防方针》，其中重要的思想是「日本的国策是成为东亚的指导者，为此一定要具备能够排除苏美英压迫的实力。在充实能够对抗苏美英的军备特别是航空兵力的同时，做好稳固日满和北支（华北），完成进行持久战的准备的基础工作。完成了军备的充实和持久战的准备后，首先开始积极工作以儘快迫使苏联放弃进攻远东的图谋。在此期间努力与美国保持亲善关係，苏联屈服后与其建立亲善关係，将英国实力驱逐出东亚，解放东亚各民族。苏联和英国屈服后，领导东亚各国合作使其实力得到飞跃发展，准备和美国的大决战」。如果日本果然按照这个发展计划来的话，恐怕现在战争的局面不是这个样子了。
但是历史的趋势不可阻挡，陆军中希望建功立业的人以石原为榜样将「下克上」的精神发挥到极致，发动了7.7事变，将日本拖入了中国这个泥潭。然后海军更是挑战了美国这个巨人，对此石原感到非常的失望，并因此对海军的狂妄冷嘲热讽。
全面抗战开始后，石原多次建议收缩防线，固守大城市，逐步地蚕食中国的土地，同时蓄积兵力。不过那个时候已经疯狂到极点的日军中没有几个人听得进去，特立独行的石原遭到了大多数人的反对，所以在东条对付他的时候，没有人为他说话。
不过现在的情况不一样了，无论是在支那大陆还是在太平洋战场，战局都往石原所设想的那边发展，石原的身边逐渐积聚了一大群信徒，连东条英机派去监视石原的宪兵都拜倒在石原的脚下。这一次反对东条「暴*」的风波中，石原的信徒出力不少，这也是东条特意来拜访自己老对手的原因。
当东条英机看见端坐房中的石原的时候，不由得有点嚮往他的生活了。因为一年多没有见到石原，失去了工作的石原反而看起来神采奕奕，年轻了许多，这跟已经开始秃顶的东条英机形成了鲜明的对比。
即使东条英机从东京赶来见他，但是石原丝毫没有感到感激。他的言辞还是如当初那般犀利。穿着传统的和服端跪坐在窗前的石原莞尔非常直接地对东条英机说到：「东条君，我从一开始就知道你不具备指导战争的能力，这样下去日本会亡国的，所以请儘早辞去内阁总理的位置」
这句话一出，在场的所有人都感到尴尬，刚刚跪坐下来的的东条英机更是脸色微红，他暗自平静了一番自己的心情，然后沉声说到：「愿听石原君的指教。」
「东条君连续犯下两个错误。第一就是在未完全消化满洲之前枉然发起对支那的全面战争，让日军主力被牢牢吸引在那里，不能有效地进行训练和作战。帝国有限的资源分散在大量的占领的土地，军费得不到很好的利用。请东条君注意日军手中的步枪、掷弹筒还有火炮，都是全面开战以前研发的，不但这么长的时间未有更新，而且每个师团所配置的数量还越来越少。武器是制胜的重要因素，如果我们凭藉这些已经落后于时代的武器跟不断更新自己武器的支那军队作战，由胜转败也在情理之中。」石原望着窗外纷纷落下的红叶，不由得感到对大日本帝国的未来感到深深的担忧，当年发动九一八事变攫取了满洲而获取的优势正在逐步的丧失。对中国的作战已经变成了持久战，而且中国已经从当初的惊慌失措中恢復了过来，日本已经丢掉了3座占领的城市。
第二捲风起云涌 第两百六十八章 火炬行动
「想必石原君说所的第二个错误就是对美国的作战吧？」东条英机口中充满了苦涩的说。当年正是石原莞尔以时机未到坚决反对，而东条英机却配合日本海军搞出了那么一出大戏。
「当然了。想不到海军那些蠢蛋居然也学你们搞速胜战。广阔的太平洋就像广阔的支那土地一样，是日军称霸的最大障碍。当年拿破崙也是因为俄国的广阔而失败的。」 石原莞尔轻蔑地说。
对此东条英机根本无法反驳，因为战争的进程说明了石原莞尔的正确，从开战后日军损失了三艘主力航母，两艘轻型航母，却没有补充任何一艘。而美国航母的损失虽然比日军还要大，但是已经有两艘新的航母加入了战斗，还有两艘正在试航。美国的经济已经转向战时，不知道中途岛还能守卫多长的时间。