1．各种作战A.基地航空兵部队的作战以基地航空兵力的主力配备在日本本土（北海道，本州、四国、九州）、西南诸岛、台湾、菲律宾方面；以一部配备在千岛列岛、南方重要地区中部大平洋方面，负责捕捉并歼灭敌舰队及敌进攻乓力。
B.机动部队及其余海上部队的作战把大部兵力配备在西南方面，按照敌情，使之进入菲律宾方面或者暂时使之进入西南诸岛；把这一部兵力配备在日本本土方面，随时进行机动作战，同时策应基地航空部队，歼灭敌舰队及进攻兵力。
C.奇袭作战儘量实行奇袭作战，特别要抓住良饥，在敌前进根据地，奇袭敌舰队，逐步削弱之。儘量以潜水艇、飞机、特殊奇袭武器等进行各种奇袭作战。
2．日本本土、西南诸岛、菲律宾方面和陆军及有关部队配合，优先加强其防务，运用种种策略，迅速努力确立适应决战的态势，如敌来攻，即动用可能集中的全部兵力，大致在我基地飞机的威力圈内，迎击来敌，将其歼灭，以确保重要地区。
在这些方面的决战，称为“捷号作战”，实行“捷号作战”的时间，由大本营决定之。
小矶、米内、梅津、及川等军政要员迫不及待地想在国防圈上的某一点与美军决战。
但是，及川突然想起自战争爆发以来一直存在的陆海军间争夺航空部队指挥权的问题，这个问题如不解决，对“捷号作战”将产生极大影响。
梅津对此表示赞同：“此次作战设想所要求的是陆海军应协调一致地使用航空兵力，陆海军可就此问题做专门研究。”
当时，空军在日本军队中还不是一个独立的军种，航空兵力分属陆海两家。陆军航空兵的基本编制是飞行师团或航空军；海军航空兵主要编在航空母舰舰队中。
根据悔津和及川的指示，大本营陆海军部立即研究对策，很快搞出了一个《关于捷号航空作战的中央协定》，详细区分了陆海军航空兵力的配备，明确了陆海军航空部队的指挥关係和作战分工。
这时，日本军政要员已经感觉到菲律宾之战已迫在眉睫，深感事态危急。如果菲律宾失守，那么日军同南洋的运输线路则全部断绝。因此．梅津决定调整菲律宾的兵力部署。7 月28 日，大本营陆军部下令解除第14 军的战斗序列，成立第14 方面军（9 月26 日任命在中国东北担任第1 方面军司令官的山下奉文大将为第14 方面军司令官），并为防卫南部菲律宾编成第35 军（8 月11 日任命铃本宗作中将为该军司令官），列入第14 方面军编成内。
8 月上旬，第14 方面军编成内计有：第35 军（辖第16、第30、第100、第102 师团及独立混成第54 旅团）、第8、第26、第103、第105 师团以及坦克第2 师团、独立混成第55、第58、第61 旅团。
9 月22 日，日本大本营又将驻上海的第1 师团编入第14 方面军战斗序列，并命令第23 师团在中国甫满地区集结，准备调往菲津宾。陆军计划菲律宾群岛位于东南亚地区，是一个由7100 多个岛屿组成的岛国，其中吕宋、比萨扬、棉兰老和已拉望等11 个岛屿的面积超过1000 多平
方公里，占全国面积的94％。菲律宾境内群山起伏，多丛林和火山，常发生地震，全国海岸线长达18533 公里，多天然良港。南方军总司令官寺内寿一接到大本营下达的作战命令后，即研究制定具体作战计划。寺内出身军人世家，其父寺内正毅曾是明治天皇的重臣，先后任过陆军大臣、参谋本部次长、朝鲜总督、首相等职务，寺内继承父业，曾任过师团参谋长、朝鲜军参谋长、师团长、台湾军司令官、陆军大臣和华北方面军司令官，太平洋战争爆发后，即为南方军总司令官，率日军攻占东南亚及西南太平洋地区岛屿。他是日军中少见的精通参谋、指挥与军政业务的军官。寺内和他的参谋们根据菲津宾的地理环境，认为美军随时随地都可能在菲律宾登陆，最有可能的登陆点是在菲律宾南部，因此，应集中兵力于南部抗击。
日本大本营仔细研究了南方军的意见后否决了它。大本营认为，菲律宾任何一个岛屿都适合登陆作战，因此不可能准确预言敌人先在什么地方发起攻击，与其把军队分散在南部各岛，不如集中兵力于吕宋，因为吕宋岛交通便利，最易于防守。寺内接受了大本营的建议，很快制定出在菲律宾固守的“捷一号作战计划”：
一、南方军和海军协同，击溃向菲津宾方面进攻的美军，摧毁其继续作战企图。
二、决战以和海军协同进行的航空作战为主，在海上歼灭敌进攻主力。
三、地面决战，力求在吕宋地区。
四、迅速整备菲律宾岛上的机场，使之适应航空部队的灵活作战。机场的整备，主要由第14 方面军担任，由第4 航空军协助。
五、地面作战准备，应依照下列吝项：
1．巴坦岛、巴布延地区以一部分乓力确保重要地区，摧毁敌军推进航空基地的企图。2.吕宋地区作为地面部队的主决战场，集结方面军的主力，歼灭企图进攻的敌军主力。
3．中南部菲律宾地区确保重要地区，以支援由海军及航空部队进行的决战。六、航空作战应依照下列各项：1．严密巡逻搜索敌人，及时识破敌军进攻的时机。2．对于